Die Grenzen des Parks erstrecken sich von den Kalksteinfelsen des Capo Caccia – die 168 Meter über dem Meeresspiegel aufragen – bis zu den Posidonia oceanica-Wiesen, die den Meeresboden in einer Tiefe zwischen fünf und vierzig Metern verankern. Diese Wiesen, die als UNESCO-Prioritätshabitat anerkannt sind, produzieren Sauerstoff in einer Rate, die mit terrestrischen Wäldern vergleichbar ist, und bieten gleichzeitig Lebensraum für Jungfische, Kraken und die gefährdete Edle Steckmuschel Pinna nobilis.
Beim Schnorcheln entlang der Küste von Alghero werden geologische Schichten sichtbar, die bis in die Mesozoische Ära zurückreichen. Die weißen Klippen des Capo Caccia bestehen aus Dolomitkalkstein, der sich absetzte, als diese Region unter einem flachen kretazischen Meer lag. Erosion formte die Höhlen des Vorgebirges – die Grotta di Nereo reicht 42 Meter unter den Meeresspiegel und ist nur über geführte Tauchgänge zugänglich – und schuf die Karsttopographie, die die terrestrische Landschaft des Parks prägt. Die Bucht von Tramariglio, geschützt durch die westliche Flanke des Kaps, bietet den ruhigsten Einstiegspunkt für Schnorcheltouren; das Morgenlicht durchdringt hier die Wassersäule bis in zwölf Meter Tiefe und beleuchtet den felsigen Untergrund, wo Zackenbarsche und Zweibindenbrassen nach Nahrung suchen.
Die marine Fauna des Parks umfasst 34 Korallenarten, darunter die Rote Koralle Corallium rubrum, die seit der römischen Antike geerntet wurde. Moderne Naturschutzgesetze verbieten die Entnahme innerhalb der Parkgrenzen, was es den Kolonien ermöglicht, an vertikalen Felswänden in 15 bis 30 Metern Tiefe zu reifen. Schnorchler, die mit zertifizierten Anbietern arbeiten, beobachten häufig gelbe Gorgonien (Eunicella cavolini), die in der Strömung schwanken und ihre Polypen ausstrecken, um Plankton zu filtern. Unechte Karettschildkröten (Caretta caretta), die seit 2019 per Satellitentelemetrie verfolgt werden, nutzen die Seegraswiesen des Parks während ihrer Sommermigration als Futterplätze.
Der Hafen von Alghero, vier Kilometer südlich des Parkeingangs in Località Tramariglio, dient als Abfahrtsort für die meisten Bootstouren zum Schnorcheln. Die Betreiber fahren am Leuchtturm von Punta Giglio vorbei – in Betrieb seit 1864 – bevor sie in Buchten ankern, wo Trias-Gestein auf das Meer trifft. Die besten Schnorchelgebiete bei Alghero liegen um diese geschützten Orte: Die Sichtweite übersteigt an ruhigen Tagen zwanzig Meter und die Wassertemperatur liegt von Juni bis September zwischen 23°C und 26°C. Die Parkverwaltung überwacht diese Zonen das ganze Jahr über und setzt Ankerverbote durch, um den Meeresboden vor Propellerschäden zu schützen.
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